 |
хромосома
DNA Изменение
в Пакистанец
Raheel Qamar,1,2 Qasim Ayub,1,2
Aisha Mohyuddin,1,2 Заусеница
Helgason,3 Kehkashan Mazhar,1 Atika
Mansoor,1 Tatiana Zerjal,2 Елей
Tyler- Кузнец и Предмет,линия в виде
буквы S. Qasim Mehdi1
1Biomedical и Генетический
Инженерное искусство Деление, Dr.
высшая отметка за классную работу Q.
Хан Исследование Лаборатория,
Islamabad; 2Cancer Исследование
Поход, Хромосома Молекулярный
Биология Группа, Отдел яние) от
Биохимия, и 3Institute яние) от
Биологический Антропология,
Университет яние) от Полуботинок,
Полуботинок, Соединяться Королевство;
и расшифровывать Генетика,
Reykjavik.
отвлеченный
Восемнадцать бинарный полиморфизм и
16 multiallelic, короткий- гуськом-
повторять (STR) месторасположение от
грамматический определенный член
nonrecombining часть яние) от
грамматический определенный член
человеческий ИГРЕК хромосома быть
тип в 718 мужской подчиненный
причастность к 12 этнический группа
яние) от Пакистанец. Этот identified
11 стойкий haplogroups и 503
соединение бинарный маркер/STR
haplotypes. Haplogroup частое
повторение быть широко подобный к
тот в neighboring географический
площадь, и грамматический
определенный член Пакистанец
народонаселение говорить высшая
отметка за классную работу язык
изолировать ( грамматический
определенный член Burushos), высшая
отметка за классную работу Dravidian
язык ( грамматический определенный
член Брама), или высшая отметка за
классную работу Китаеведение-Tibetan
язык ( грамматический определенный
член Balti) походить грамматический
определенный член
Indo-European–speaking большинство
Несмотря на, медиана- соединять
плетенка яние) от haplotypes
открывать значительный фундамент
яние) от ИГРЕК изменение в
Пакистанец, с многие народонаселение
показывать отдельный кисть яние) от
haplotypes. Этот образец мочь быть
счет для у высшая отметка за
классную работу общий лужа яние) от
ИГРЕК происхождение, с реальный
изоляция между народонаселение и
медленное течение в грамматический
определенный член маленький самого
Немногие сравнительный генетический
или исторический данные быть
доступный для наибольший
народонаселение, только
грамматический определенный член
следовать мочь быть сравнивать с
устный традиция кругом источник
Грамматический определенный член
ИГРЕК данные поддерживать
грамматический определенный член
колодец- учрежденный источник яние)
от грамматический определенный член
Делать грамматический разбор в
Иранский, грамматический
определенный член внушать спуск яние)
от грамматический определенный член
Шанс от Genghis Хан армия, и
грамматический определенный член
источник яние) от грамматический
определенный член Негрообразный
Makrani в Африканец, только не надо
поддерживать традиция яние) от
Tibetan, Сирийский, Грек, или
Еврейский источник для другой
народонаселение.
внесение
Грамматический определенный член
earliest очевидность яние) от
Paleolithic человеческий присутствие
в грамматический определенный член
Юг Азиатский состоять из яние) от
камень орудие закладывать
разбрасывать всюду грамматический
определенный член Soan Река Долина в
северный Пакистанец ( гусар 1997).
Злоба грамматический определенный
член недостаток яние) от
окаменелость очевидность, этот
рабочий показываться к показывать
грамматический определенный член
присутствие яние) от возвращающийся
домой в грамматический определенный
член Юг Азиатский как ранний как
200,000–400,000 очень давно (Wolpert
2000) и так быть вероятный к
вспомогательный глагол для
образования сложных времен быть
соединять с архаический Homo вид.
Пакистанец lies на грамматический
определенный член постулировать
южанин береговой маршрут
последователь у анатомический
современный Homo Мудрость из яние)
от Африканец, и так май
вспомогательный глагол для
образования сложных времен быть
населенный у современный
человеческий как ранний как
60,000–70,000 очень давно. Там быть
очевидность яние) от пещера житель в
Пакистанец лежащий,обращенный к
северу граница, только окаменелость
очевидность от грамматический
определенный член Paleolithic
вспомогательный глагол для
образования сложных времен быть
обрывочный ( гусар 1997).
Очевидность вспомогательный глагол
для образования сложных времен быть
снимать крышку в Mehrghar, в сильный
юго-западный ветер Пакистанец,
указание Неолитический поселение от
как давно как 7,000 b.c. (резкий
1991), который быть последователь у
грамматический определенный член
Indus Долина цивилизация ( включая
грамматический определенный член
придавать городской вид яние) от
Harappa и Mohenjodaro) тот пышно
расти в грамматический определенный
член 3d и 2d тысячелетие b.c. (житель
горных долин 1991). Всюду 1500 b.c.,
грамматический определенный член
Indo-European–speaking кочевой
пастушеский член рода от дальше
north—often гость грамматический
определенный член Aryans—crossed
грамматический определенный член
Karakorum Гора в грамматический
определенный член Юг Азиатский.
Последующий исторический случай
заключать грамматический
определенный член вторжение яние) от
Александрийский грамматический
определенный член Великий (327–325
b.c.) и грамматический определенный
член Араб и Мусульманин завоевание
от 711 a.d. продвигающийся вперед (Wolpert
2000).
Грамматический определенный член
присутствующий народонаселение яние)
от Пакистанец состоять из яние) от
большой чем 160 миллион личный (
согласно к 2005 КТО фигура) кто
принадлежать к в наименьший 18
этнический группа и говорить большой
чем 60 язык ( глубоко въевшаяся
грязь,сажа 1992). Наибольший яние)
от этот язык быть Indo- Европейский,
только они тоже заключать сильная
форма,грамматически неопределенный
член изолировать, Burushaski; высшая
отметка за классную работу Dravidian
язык, Брама; и высшая отметка за
классную работу Китаеведение-Tibetan
язык, Balti. Панджабский- говорить
личный форма грамматический
определенный член большинство
народонаселение яние) от Пакистанец,
только они представлять высшая
отметка за классную работу сложный
примесь яние) от этнический группа (Ibbetson
1883) и быть не анализировать здесь;
12 этнический группа быть заключать
в сегодня обозревать. информация
доступный кругом их быть суммировать
в стол 1, вместе с гипотеза кругом
их источник (Mehdi et al. 1999).
Хотя некий яние) от этот гипотеза
быть колодец- сторонник (e.g.,
грамматический определенный член
источник яние) от грамматический
определенный член Делать
грамматический разбор в Иранский),
наибольший быть основа на устный
традиция и вспомогательный глагол
для образования сложных времен не
быть лицо,производящее
испытание,анализ от другой исток
яние) от очевидность.
Скудный генетический данные быть
доступный для этот Пакистанец
этнический группа Ранний научное
занятие яние) от грамматический
определенный член ABO кровь группа и
классический протеин маркер делать
не заключать весь группа и по
большей части классифицировать их
согласно к их место яние) от
проживание. ВЫСШАЯ ОТМЕТКА ЗА
КЛАССНУЮ РАБОТУ народонаселение
дерево основа на 54 классический
энзим маркер место грамматический
определенный член Шанс и Тропинка в
грамматический определенный член
Запад Азиатский кисть содержать в
себе грамматический определенный
член северный Caucasoids (кавалькада-Sforza
et al. 1994). В еще один
народонаселение дерево, основа на 47
классический протеин полиморфизм,
грамматический определенный член
Пакистанец образец форма высшая
отметка за классную работу маленький
subcluster в грамматический
определенный член Индоевропейский
оратор от India ( кавалькада-Sforza
et al. 1994).
Грамматический определенный член
ИГРЕК хромосома заготовлять высшая
отметка за классную работу
единственный в своем роде исток яние)
от генетический очевидность (Tyler-
Кузнец 1999; Безработный и Tyler-
Кузнец 2000). Он носильщик
грамматический определенный член
крупный масштаб nonrecombining часть
в грамматический определенный член
геноцид и содержать в себе
многочисленный стойкий бинарный
маркер, включая основа замена (видеть,
e.g., Тайно et al. 1997) и
retroposon вставление ( молоток
1994; Santos et al. 2000), который
мочь быть употребление в сочетании с
большой- быстрый развивать маркер,
такой как microsatellites (видеть,
e.g., Ayub et al. 2000).
Следовательно, очень подробность
ИГРЕК филогенез мочь быть строить
тот позволять мужской- особый вид
яние) от генетический история к быть
расследовать. Этот быть сильные
влияние у грамматический
определенный член маленький
действительный народонаселение
размер яние) от грамматический
определенный член ИГРЕК хромосома,
ведущий к быстрый генетический
медленное течение, и у
грамматический определенный член
практика яние) от patrilocality в
многие общество, ведущий к высокий
плоская,горизонтальная поверхность
яние) от географический
дифференциация яние) от ИГРЕК
haplotypes. Несмотря на
грамматический определенный член
произведение искусства Qamar et al.
(1999) на грамматический
определенный член анализ яние) от
Тявканье+ хромосома ( обнимать ~2.6%
яние) от грамматический определенный
член весь) и анализ яние) от STR
изменение (Ayub et al. 2000;
Mohyuddin et al. 2001), маленький
работа вспомогательный глагол для
образования сложных времен быть
носильщик из на Пакистанец ИГРЕК
хромосома. Поэтому, мы
вспомогательный глагол для
образования сложных времен теперь
исполнитель сильная
форма,грамматически неопределенный
член обширный анализ яние) от
Пакистанец ИГРЕК происхождение, к
устанавливать какой свет они мочь
ронять на грамматический
определенный член источник и
генетический история яние) от
грамматический определенный член
подгруппа тот пополнять
грамматический определенный член
Пакистанец народонаселение.
материальный
и Метод
образец
Грамматический определенный член
ИГРЕК хромосома яние) от 718
несвязанный мужской подчиненный,
причастность к 12 этнический группа
яние) от Пакистанец, быть
анализировать (стол 1 и 2; винная
ягода. 1). Осведомленный соглашаться
быть получать от весь участник в
этот научное занятие. Сильная
форма,грамматически неопределенный
член Epstein Барак virus–transformed
lymphoblastoid тюремная камера шнур
быть учрежденный от каждый личный, и
DNA быть удалять от этот тюремная
камера солдат линейных войск для
анализ.
Бинарный
Полиморфизм
Тип
Мы тип 15 SNPs, сильная
форма,грамматически неопределенный
член Alu вставление ( молоток 1994;
Молоток и Ежечасный 1995), высшая
отметка за классную работу Шнур
вставление (Santos et al. 2000), и
грамматический определенный член
12f2 вычеркивание (Casanova et al.
1985). Грамматический определенный
член основа замена быть 92R7
Музыкальная нота до?T (Mathias et
al. 1994); M9 Музыкальная нота
до?НОТА СОЛЬ ( тайно et al. 1997);
SRY-2627 Музыкальная нота до?T
(Bianchi et al. 1997); SRY-1532
высшая отметка за классную
работунота сольВЫСШАЯ ОТМЕТКА ЗА
КЛАССНУЮ РАБОТУ (Whitfield et al.
1995; Kwok et al. 1996; Santos et
al. 1999b); sY81 (DYS271) Высшая
отметка за классную работу?НОТА СОЛЬ
(Seielstad et al. 1994); SRY-8299
Нота соль?Высшая отметка за классную
работу (Santos et al. 1999a);
Подходящий нота сольВЫСШАЯ ОТМЕТКА
ЗА КЛАССНУЮ РАБОТУ ( панда,кошачий
медведь et al. 1998); SRY +465
Музыкальная нота до?T ( голень et
al. 1999); LLY22g Музыкальная нота
до?ВЫСШАЯ ОТМЕТКА ЗА КЛАССНУЮ РАБОТУ
и Плести кружево T?МУЗЫКАЛЬНАЯ НОТА
ДО переход (Zerjal et al. 1997).
Вдобавок, грамматический
определенный член M17 маркер ( тайно
et al. 1997) быть тип, у
употребление яние) от грамматический
определенный член букварь
GTGGTTGCTGGTTGTTACGT и
AGCTGACCACAAACTGATGTAGA
последователь у AflIII пищеварение
яние) от грамматический определенный
член PCR продукт; грамматический
определенный член наследственный
hallelujah быть не
средство,способствующее пищеварению
Грамматический определенный член M20
маркер (тайно et al. 1997) быть
генотип, у употребление яние) от
грамматический определенный член
букварь CACACAACAAGGCACCATC и
GATTGGGTGTCTTCAGTGCT последователь у
SspI пищеварение; грамматический
определенный член Высшая отметка за
классную работу?НОТА СОЛЬ изменение
уничтожать грамматический
определенный член местоположение в
положение 118 в грамматический
определенный член 413-bp продукт.
M11 (тайно et al. 1997) быть тип,
using грамматический определенный
член букварь TTCATCACAAGGAGCATAAACAA
и CCCTCCCTCTCTCCTTGTATTCTACC
последователь у пищеварение с MspI.
Грамматический определенный член
215-bp продукт быть
средство,способствующее пищеварению
к 193-bp и 22-bp обломок в
грамматический определенный член
происходить hallelujah
Грамматический определенный член
RPS4Y Музыкальная нота до?T
изменение (айсберг et al. 1999) быть
открывать у BslI ограничение
пищеварение яние) от высшая отметка
за классную работу 528-bp PCR
продукт получать у употребление яние)
от грамматический определенный член
букварь CCACAGAGATGGTGTGGGTA и
GAGTGGGAGGGACTGTGAGA. Грамматический
определенный член наследственный
МУЗЫКАЛЬНАЯ НОТА ДО hallelujah
содержать в себе два местоположение,
и грамматический определенный член
происходить T hallelujah содержать в
себе один. M48 (тайно et al. 1997),
высшая отметка за классную
работуНота соль, быть тип у
hallelujah- особый PCR using
грамматический определенный член
отличительный букварь
TGACAATTAGGATTAAGAATATTATA и
TGACAATTAGGATTAAGAATATTATG и
обыкновенный человек букварь
AAAATTCCAAGTTTCAGTGTCACATA к
порождать особый 145-bp продукт
Грамматический определенный член
ставить яние) от ИГРЕК бинарный
маркер hallelujah носильщик у высшая
отметка за классную работу
единственный личный воля быть
приписывать к как “the Игрек
haplogroup.”
Яние) от грамматический определенный
член 718 образец, 717 мех в
haplogroups ожидать на
грамматический определенный член
основание яние) от грамматический
определенный член знать филогенез,
только один Тропинка образец
(PKH134) недоставать к расширять в
грамматический определенный член SRY
–1532 и M17 месторасположение. Он
быть уполномоченный к haplogroup 3
на грамматический определенный член
основание яние) от альтернатива SRY
–1532 букварь ( подробность на
просьба) и принадлежащий ему STR
профиль.
игрек-STR
Тип
Пять trinucleotide- повторять
полиморфизм (DYS388, DYS392, DYS425,
DYS426, и DYS436), десять
tetranucleotide- повторять
полиморфизм (DYS19, DYS389I,
DYS389b, DYS390, DYS391, DYS393,
DYS434, DYS435, DYS437, и DYS439) и
один pentanucleotide microsatellite
(DYS438) быть тип полностью ИГРЕК
хромосома. Три сложный PCR реакция
быть исполнитель для весь ИГРЕК-STRs,
в a10-µl конечный реакция том
содержать в себе 20 ng геноцид DNA,
как описывать где-нибудь в другом
месте ( Фома et al. 1999; Ayub et
al. 2000). PCR продукт быть говорить
без умолку сильная
форма,грамматически неопределенный
член ABI 377 последовательность.
ABIGS350 TAMRA быть употребление как
грамматический определенный член
внутренний узкая дорога знамя.
Грамматический определенный член
ПРОИСХОЖДЕНИЕ и ГЕНОТИП мягкая
древесина тюк быть привыкший
собирать грамматический определенный
член данные и к анализировать
обломок размер ИГРЕК-STR hallelujah
быть название согласно к
грамматический определенный член
число яние) от повторять единица они
contain.The некоторое количество
повторять единица быть учрежденный
через грамматический определенный
член употребление яние) от
последовательность передача на
рассмотрение в другую инстанцию DNA
образец. Hallelujah длина для
DYS389b быть получать у вычитание
яние) от грамматический определенный
член DYS389II hallelujah длина от
DYS389I.
ИГРЕК-STR удваивание быть
закладывать в несколько
месторасположение. DYS393 быть
двойной в PKH165 (13 и 15) и DYS437
быть двойной в SDH181 (8 и 9).
ВЫСШАЯ ОТМЕТКА ЗА КЛАССНУЮ РАБОТУ
большой сложный образец быть
закладывать в DYS425, где два к
четыре hallelujah быть закладывать в
36 личный от haplogroups 8, 9, 13, и
21.
данные
Анализ
Главный- компонент анализ быть
носильщик из на haplogroup частое
повторение у употребление яние) от
грамматический определенный член
Перспектива ( зрительный Статистика)
система мягкая древесина, перевод
5.0.2 (молодой и Знамя 1996). Для
графический изображение,
грамматический определенный член
первый и второй главный компонент
быть заговорщик у грамматический
определенный член Микроскоп Служба
Свита Превосходить Тюк на Окно 2000.
Biallelic полиморфизм данные для
различный мир народонаселение
употребление в грамматический
определенный член анализ быть
получать от Молоток et al. (2001).
Примесь быть оценивать у
употребление яние) от три другой
мера: Длинный вес наименьший-
квадрат (WLS) мера ( длинный 1991);
мистер, высшая отметка за классную
работу наименьший- квадрат оценщик (мантия
и Hiorns 1965); и m? (Helgason et
al. 2000).
Анализ яние) от молекулярный
изменение (AMOVA) быть носильщик из
у употребление яние) от
грамматический определенный член
Arlequin тюк (Schneider et al.
1997). AMOVA мера грамматический
определенный член пропорция яние) от
изменение расхождение закладывать в
и между народонаселение, относящийся
к каждому в отдельности. Хотя много
яние) от грамматический определенный
член изменение в грамматический
определенный член быстрый изменение
microsatellite месторасположение
быть ожидать к вспомогательный
глагол для образования сложных
времен быть предъявлять в
грамматический определенный член
другой Пакистанец subpopulations,
грамматический определенный член
единственный в своем роде изменение
случай в грамматический определенный
член бинарный месторасположение быть
много старый и вспомогательный
глагол для образования сложных
времен не случай в грамматический
определенный член контекст яние) от
грамматический определенный член
подразделение яние) от
грамматический определенный член
Пакистанец народонаселение. Мы
придумывать грамматический
определенный член следующий
стратегия к подвиг грамматический
определенный член максимум доходить
до яние) от уместный изменение
информация от грамматический
определенный член ИГРЕК- хромосома
haplotypes. STR изменение в
haplogroups быть привыкший вычислить
народонаселение pairwise FST
ценность для каждый личный
haplogroup. Для каждый
народонаселение пара, высшая отметка
за классную работу вес захудалый FST
быть вычисленный, где грамматический
определенный член ценность получать
для каждый haplogroup быть вес
согласно к грамматический
определенный член пропорция яние) от
pairwise сравнение завертывать тот
haplogroup. В грамматический
определенный член отсутствие яние)
от высшая отметка за классную работу
индивидуальный haplogroup от один
народонаселение, Высшая отметка за
классную работу, яние) от
грамматический определенный член
пара ВЫСШАЯ ОТМЕТКА ЗА КЛАССНУЮ
РАБОТУ и Нота си, FST быть вступать
в бой 1, и грамматический
определенный член число яние) от
pairwise сравнение быть брать как
грамматический определенный член
число яние) от хромосома везти тот
haplogroup в Нота си. Ценность яние)
от FST основа на STRs один или на
STRs плюс бинарный маркер, с
бинарный маркер давать высшая
отметка за классную работу 10-
складывать высокий вес, быть
вычисленный для сравнение. Полностью
яние) от этот анализ, грамматический
определенный член расстояние матка
употребление консистенция яние) от
грамматический определенный член
число яние) от шаг у который каждый
пара яние) от haplotypes разница.
Камин испытание для грамматический
определенный член значение яние) от
соотношение между FST ценность быть
носильщик из в Arlequin, и
multidimensional скалярный (MDS)
участок земли быть строить у
употребление яние) от грамматический
определенный член SPSS перевод 7.0
мягкая древесина тюк.
Медиана- соединять плетенка быть
строить у Плетенка 2.0b ( лента для
волос et al. 1999). ВЫСШАЯ ОТМЕТКА
ЗА КЛАССНУЮ РАБОТУ вес система с
высшая отметка за классную работу
пять- складывать выстраивать в ряд
быть употребление в грамматический
определенный член строительство яние)
от грамматический определенный член
плетенка. Грамматический
определенный член вес уп |
